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介绍 半岛bd体育手机客户端 及特点 白喉杆菌(Corynebacterium diphtheriae)是引起小儿白喉的病原菌,属于棒状杆菌属(Corynebacterium)。菌体大小为(0.3~0.8μm)×(1~5μm),细长稍弯,粗细不一,菌体一端或两端排列呈棒状,排列不规则,常呈L、V、X、T等字形或排成栅栏状。本菌的致病物质主要是白喉毒素,可尚产生一些侵袭性物质,如类似于结核杆菌的索状因子(Cord factor),能破坏细胞的线粒体膜,导致呼吸和氧化磷酸化作用受到抑制。 因此快速灵敏检测白喉棒杆菌具有重要意义。本半岛bd体育手机客户端 就是以探针法荧光定量PCR技术为基础开发的专门检测白喉棒杆菌通用型的试剂盒,它具有下列特点: 1、即开即用,用户只需要提供样品DNA模板。 2、引物和探针经过优化,灵敏性高。 3、提供阳性对照,便于区分假阴性样品。 4、特异性高,引物是根据白喉棒杆菌通用DNA高度保守区设计,不会跟其他微生物的DNA发生交叉反应。 5、既可用于定性检测,又可用于定量检测。用于定量检测时线性范围至少为5个数量级。 6、本半岛bd体育手机客户端 足够50次20μL体系的探针法荧光定量PCR反应。 7、本半岛bd体育手机客户端 只能用于科研。 格及成分
运输及保存 低温运输,-20℃保存,保存期限为12个月。 自备试剂 样品DNA。 使用方法 一、稀释标准曲线样品(以10E1-106拷贝/μL这6个10倍稀释度为例)。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分。为增加半岛bd体育手机客户端 稳定性和避免扩散传染性病原,本半岛bd体育手机客户端 不提供活体样品做阳性对照,只提供无传染性的DNA片段作为阳性对照。 1、标记6个离心管,分别为6,5,4,3,2,1。 2、用带芯枪头分别加入45 μL荧光PCR专用模板稀释液,**用带芯枪头,下同。 3、在6号管中加入5 μL 1×107拷贝/μL的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡1分钟,得1×106拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。 4、换枪头,在5号管中加入5 μL 1×106拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×105拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。 5、换枪头,在4号管中加入5 μL 1×105拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×104拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。 6、重复上面的操作直到得到6个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。 二、样品DNA的制备 7、如果有N个样品待提取,**设置N+2个提取,多出的是PC(样品制备阳性对照)和NC(样品制备阴性对照)。可以取阳性对照的1000倍稀释液10μL再加上一定量的水,使总体积与待提取样品的规定体积一致,以此作为PC。另外用水作为NC。 8、用自选方法纯化样品的DNA,本试剂盒跟市场上大多数DNA提取试剂盒兼容。 三、ProbeqPCR反应(20μL体系,在样品制备室进行) 9、如果做定量分析并且只做1次重复,则标记N+9个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做1次重复,则标记N+4个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),1个用于PCR阳性对照(用第4号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。 10、在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最后加):
11、盖上盖子后上机,按下面参数进行PCR:
四、数据处理 12、如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品RNA浓度的log值,再推算出其浓度。 13、如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照Ct必须大于或等于40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于或等于38。对待测样品,如果其Ct大于或等于40则为阴性,如果小于或等于38则为阳性。如果在38-40之间,则重复一次。重复实验的Ct值如果大于或等于40则为阴性,如果小于40,则为阳性。 |
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