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酶试剂 >> 限制性内切酶
MspJI
MspJI图片
半岛bd体育手机客户端 别名: 限制性内切酶MspJI
限制酶产地: 国产限制性内切酶
半岛bd体育手机客户端 介绍
  • 100% activity in rCutSmart?Buffer (over 210 enzymes are available in the same buffer) allowing for easier double digests
  • Specificity to epigenetically-relevant DNA modifications (5-mC and 5-hmC)
  • Restriction Enzyme Cut Site: CNNR(9/13)

MspJI 是一款经 EpiMark?验证过的半岛bd体育手机客户端 。它是一种修饰依赖型核酸内切酶,可以识别mCNNR 位点并能在修饰的胞嘧啶 3? 一侧 N9/N13处酶切双链 DNA。能被识别的胞嘧啶修饰包括 C5-甲基化胞嘧啶(5-mC)和 C5-羟甲基化胞嘧啶(5-hmC)(1)。
此酶配有酶激活溶液,可用于 MspJI 的高效酶切。
在真核生物有机体中发现的最常见表观遗传学修饰为 CpG 或 CHG 位点处的甲基化标记。这些修饰位点的一部分由 MspJI 识别并酶切。
在完全甲基化的 CpG 位点处:
5? . . . Y NmC G N R . . . 3?
3? . . . R N GmC N Y . . . 5?
或 CHG 位点处:
5? . . . YmC H G R . . . 3?
3? . . . R G DmC Y . . . 5?
R = A 或 G
Y = C 或 T
H = A 或 C 或 T(非 G)
D = A 或 G 或 T(非 C)
MspJI 单独识别每个半甲基化位点并进行双向酶切,以分别生成 32 碱基或 31 碱基的片段。这些片段包含甲基化中心位点,并在各个末端具有 4 碱基 5? 突出末端。MspJI 不会对未修饰的 DNA 进行酶切。

半岛bd体育手机客户端 来源

大肠杆菌菌株,携带有克隆自分枝杆菌( Mycobacterium)属 JLS 菌株的 MspJI 基因。

  • 特性和用法

    单位定义

    一个单位是指在 50 ?l 的总反应体系中,37℃ 条件下,1 小时内酶切 1 ?g pBR322(dcm+)DNA 所需的酶量。

    反应条件

    1X rCutSmart? 缓冲液
    Supplement with 1X 酶激活溶液
    Incubate at 37℃

    1X rCutSmart? 缓冲液
    50 mM Potassium Acetate
    20 mM Tris-acetate
    10 mM Magnesium Acetate
    100 ?g/ml Recombinant Albumin
    (pH 7.9 @ 25℃)

    在不同缓冲液中的活性

    NEBuffer? r1.1: <10%
    NEBuffer? r2.1: <10%
    NEBuffer? r3.1: <10%
    rCutSmart? Buffer: 100%

    稀释兼容性

    • 稀释液 B

    贮存溶液

    10 mM Tris-HCl
    300 mM NaCl
    1 mM DTT
    0.1 mM EDTA
    500 ?g/ml BSA
    50% Glycerol
    pH 7.4 @ 25℃

    热失活

    65℃ for 20 minutes

    甲基化敏感性

    dam甲基化: 不敏感
    dcm甲基化: 不敏感
    CpG甲基化: 不敏感

  • 注意事项

    1. 此酶已被用于表观遗传学分析,分析显示,在两条链中均含有甲基化的 CpG 位点的目标 DNA 可被 MspJI 酶切,以生成包含甲基化 CpG 位点的 32 bp 片段。可对获得的 32 bp 片段进行测序,以揭示 5-mC 修饰位点(Cohen-Karni et al.,(2011)PNAS 108: 11040-11045)。
    2. 过量使用酶会抑制酶切。您需要优化每种底物 DNA 进行完全酶切所需的酶量。
    3. 延长酶切时间、酶浓度或活化剂浓度高或甘油浓度 > 5% 等非理想的反应条件下可能出现星号活性,包括非甲基化 DNA 底物的酶切。为实现高效的专一性酶切,同时避免产生星号活性,您需要优化每种底物 DNA 所需的酶量。
    4. 可通过以下方式实现 5-mC 位点的**特异性酶切,在 1X 酶激活溶液中,将 MspJI 与 5-mC 识别位点的摩尔比介于 0.1:1 到 1:1 之间,酶切时间不超过 60 分钟。(MspJI 的摩尔浓度约为 7.4 μM)。
    5. 对 CpG、dcm 或 dam 甲基化均不敏感。
    6. 延时酶切、高浓度酶或 >5% 的甘油浓度可能产生星号活性

  • 参考文献

    1. Zheng, Y. et al. (2010).Nucl. Acids Res. doi:10, 1093/nar/gkq327.
    2. U.S. Publication No. 2010-0167942 Unpublished observation
    3. Cohen-Karni D et al. (2011). The MspJI family of modification dependent restriction endonucleases for epigenetic studies..Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.. Jul 5;108(27):, 11040-5.

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