凝胶色谱（GPC）可以将分子体积大小不同的化合物分离，凝胶渗透色谱的分离基础是溶液中溶质分子的大小不同。这种方法对流动相的要求不高，实验条件比较温和，重复性好，分析速度快、溶质回收率高，是最为方便的样品净化技术。对食品、动物组织、土壤、中药的小分子有机物进行分析时，一般样品的萃取物含有大量的大分子物质，如脂肪、色素等，会极大干扰检测结果。采用GPC净化样品，可除去脂肪、蛋白、色素等大分子干扰物质，保证分析结果的稳定性。
凝胶净化分离示意图:

GPC凝胶净化系统选择要点：
1、使用双柱塞恒流泵，比单柱塞恒流泵流量更加稳定，结果准确；
2、具有馏分收集器的净化系统，可在进样后无人操作；
3、具有自动进样器的净化系统，可将样品瓶放置后无人操作；
4、自动进样器带有刺穿瓶盖功能，可使用密封样品瓶，减少样品损失；
5、凝胶净化系统与固相萃取联用，样品净化周期更短，自动化程度更高；
6、使用制备色谱泵，样品制备量选择更为灵活；
7、使用全波长检测器，波长选择更为灵活，检测范围更广；
8、净化系统的整合性高，则故障少、使用方便；
GPC凝胶净化系统选择指南：
GelMaster TM 是上海科哲公司推出的GPC净化系统品牌，拥有国内最为齐全的半岛bd体育手机客户端 线，性能国内领先。旗下拥有GelMaster-5000GS、GelMaster-3000、GelMaster-2000、GelMaster-1000四种不同类型的半岛bd体育手机客户端 ，针对于不同类型的客户。
GelMaster-5000GS型是一种联用系统，主要面对GPC与固相萃取使用均很频繁、对实时性要求很高的客户，如：农药残留、兽药残留、毒物分析、血药分析等复杂样品的前处理，适应食品安全、药品安全的突发事件的处理，极大的减少分析时间，减少误差。
GelMaster-3000型实现了从进样到分离的高度自动化，主要用于样品数量多，人员较为紧张的实验室，可以无人化长时间连续操作，大量节约分析人员时间，保证其工作效率。
GelMaster-2000型分离过程实现了自动化，主要用于样品数量一般，人员较为紧张的实验室，分析人员可以在纯化的过程中，从事其他工作，提高了效率、降低了劳动强度。
GelMaster-1000型结构简单、维护容易。主要适用于经费较少，样品较少的实验室，可以处理少量样品，而且体积小、搬运容易，也可以用于车载与流动监测。