免疫生物磁珠分离技术借助免疫生物磁珠捕获样品中靶物质，通过生物磁珠在磁场中的运动使靶物质(如病原微生物)分离。免疫生物磁珠由磁性载体和免疫配基结合而成。天然磁性材料可从磁性细菌中分离获得，如从磁性细菌体内提取纳米生物磁珠，在其表面联上大肠杆菌抗体后用于分离大肠杆菌，但该方法成本较高，因而多采用工业方法制备。1979年，研发出了能生产直径1.5～100?m、结构对称的多聚体超顺磁性微球(简称“磁珠”)的技术。该技术生产的磁珠仅在磁场中表现出磁性，因此向样品中加入磁珠时，磁珠分散并能与样品充分混合；当在试管一侧添加强磁场时，磁珠能迅速发生力学迁移并吸附在靠近磁场的试管内壁，移除样品后即可将磁珠分离。

免疫配基包被于磁珠外表面，主要包括一抗、二抗和蛋白质A/G。包被一抗的免疫生物磁珠可直接使用，方便快捷，但仅适用于特定靶物质的分离；包被二抗或蛋白质的生物磁珠必须再包被一抗才能捕获相应靶物质，但其能与多种相应的一抗结合，灵活性强。

免疫生物磁珠表面的特异抗体能与样品中的靶物质(具有相应的表面抗原)发生免疫反应，形成免疫生物磁珠—靶物质复合物。在外加磁场中，免疫生物磁珠 一靶物质复合物被吸附并滞留在磁场中，而无相应表面抗原的物质由于不能与免疫生物磁珠表面的特异抗体结合，没有磁性，不能在磁场中停留，从而可分离靶物质。