1、根据实验需求选择合适的孔径
孔径通常由您的应用或使用目的来决定。支原体可以用0.1μm孔过滤器去除。大多数培养基、缓冲溶液、生物液和气体的常规实验室除菌通常采用0.22μm孔过滤器完成。溶液和溶剂的澄清和预过滤最好用0.45μm或孔径的过滤膜操作。
Tip(当试图控制支原体时，可同时加入环丙沙星过滤盐酸盐(HCl)。它是一种4-氟喹诺酮类抗生素常用来控制支原体受感染的污染细胞系)
请参看下表，来为您的应用选择匹配的推荐膜和孔径。
| 应用 | 孔径um |
| 去除支原体 | 0.1 |
| 水性溶液的除菌和超净处理、溶剂的超净处理(HPLC) | 0.22 |
| 水性溶液的澄清、溶剂的澄清(HPLC) | 0.45 |
2、为您的应用选择最佳滤膜材质
您的过滤器装置必须和样品的化学性质完全相容。一些过滤膜含有可能对一些应用造成干扰的无毒的润湿剂。另一些滤膜可能结合蛋白质或其它大分子，从而导致过滤器过早堵塞或高价值样品的损失。因此，了解样品性质以及滤膜对与之接触的溶液的潜在影响是非常重要的。
| 醋酸纤维素CA | 尼龙NYLON | 聚醚砜PES | 混合纤维素MCE | 特氟龙PTFE | |
| 蛋白结合 | 非常低 | 低至中 | 非常低 | 低 | 不适用 |
| DNA结合 | 非常低 | 非常低 | 非常低 | 低 | 不适用 |
| 耐化学性 | 低 | 中至高 | 低 | 非常高 | 非常高 |
聚醚砜(PES)
滤膜强烈推荐用于过滤细胞培养基。PES结合蛋白质的能力和可提取物含量都非常低。PES膜的流速也高于纤维素或尼龙膜。
醋酸纤维素酯膜(CA)
滤膜对多数大分子的结合亲和力非常低，尤其适用于要求低蛋白结合作用的应用，例如含血清培养基的过滤。
尼龙膜(聚酰胺NYLON)
本质上是亲水性的，推荐用于对可提取物含量要求非常低的应用，因为它们不含任何润湿剂、清洁剂或表面活性剂。尼龙膜的耐化学性能较强，适于过滤腐蚀性较大的溶液，例如酒精和DMSO。
特氟龙?(PEFE，聚四氟乙烯)
膜本质上并且永远是疏水性的，适于过滤气体，包括增湿的空气。特氟龙膜的耐化学性极佳，这使其非常适于过滤其它滤膜不能过滤的溶剂或其它腐蚀性化学品。由于其疏水性，特氟龙膜在过滤水性溶液以前必须用溶剂(例如乙醇)预先润湿。
3、选择合适滤膜直径以优化流速和膜通量
选择一个具有充足的容量或通量，从而能够快速高效地处理所有样品的过滤器。这主要取决于膜的有效表面积。
| 过滤膜直径 | 有效过滤面积(cm2) | 预计通量(ml) |
| 50mm | 19.6 | 150-750 |
| 70mm | 39.5 | 500-2500 |
| 91mm | 65 | 1000-5000 |
较低值为粘性或含颗粒溶液的典型值；较高值为缓冲液或无血清培养基的典型值
TIP
1、离心将去除大部分悬浮颗粒并减少过滤器堵塞，改善流速和吞吐量。也可以预过滤减少颗粒负荷和过早的膜堵塞。
2、液体温度的影响
对于大多数应用，在室温下过滤溶液没有问题。通常增加溶液的温度会增加流速。例如，将细胞培养基的温度从4℃增加至37℃会使流速加倍。这最可能是由于培养基粘度的下降。但是，在一些情况下，较低温度下过滤会增加总通量，对血清等含蛋白质和脂肪的溶液尤其如此。
3、压差的影响
对于真空过滤，建议采用400mm Hg(7.73 psig)的压差(真空)。再增加压差只会使流速提高一点，但是可能导致过量泡沫的形成，因为滤出液中的气体会从溶液中逸出产生气泡。在过滤加入碳酸氢盐缓冲液的细胞培养基时这个问题尤其突出。在较高的压差下，培养基中溶解的二氧化碳将很快逸出，导致pH值上升，如果培养基中含有血清蛋白则形成过量的泡沫。
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